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          當?shù)貢r間11月4日,2019年國際基因工程機器設(shè)計大賽(iGEM)在美國波士頓Hynes Convention Center圓滿落幕。代表電子科大參賽的實驗隊(UESTC-China)和軟件隊(UESTC-Software)從全球44個國家的376支隊伍中脫穎而出,憑借“BioMaster2.0”和“An expired drug solution”兩個項目,雙雙獲得金牌,軟件隊還獲得了Best Software Project,實驗隊獲得Best Hardware提名獎。

            至此,電子科技大學(xué)代表隊已經(jīng)創(chuàng)造了連續(xù)七年奪金、四次最佳單項獎、六次最佳單項獎提名的成績。兩支隊伍用行動向世界展現(xiàn)了成電人自強不息、拼搏向上的奮斗精神。

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          披荊斬棘 砥礪前行

            今年3月,在教務(wù)處的大力支持下,來自生命學(xué)院、醫(yī)學(xué)院、軟件學(xué)院、外國語學(xué)院、格拉斯哥學(xué)院的31名同學(xué)加入iGEM校集訓(xùn)隊(其中實驗隊16名,軟件隊15名),在沒有暑假、沒有周末的半年內(nèi)進行了封閉式訓(xùn)練,在教練的帶領(lǐng)下如火如荼地開展備賽工作。

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          作為環(huán)境組的參賽隊,實驗隊UESTC-China從解決抗生素耐藥性的問題出發(fā),著眼于抗生素污染問題,提出一種過期藥品解決方案。方案主要由三個主要部分組成:合成生物學(xué)系統(tǒng)、硬件設(shè)計以及數(shù)學(xué)建模。首先,合成生物學(xué)的系統(tǒng)以環(huán)丙沙星(CIP)為例,由CIP檢測質(zhì)粒、CIP降解質(zhì)粒以及自殺開關(guān)質(zhì)粒組成。其次,在項目中他們設(shè)計了一個過期藥品回收箱——Drug Avenger,與合成生物學(xué)系統(tǒng)結(jié)合實現(xiàn)了檢測并降解過期藥品的功能。最后是數(shù)學(xué)建模,首次與人類實踐結(jié)合建立了裝置布點模型,只需要更換關(guān)鍵數(shù)據(jù),任何國家/地區(qū)都可以使用模型科學(xué)合理的投放過期藥物回收箱。此外,他們參觀了成都市第四凈水廠,走訪調(diào)查連鎖藥店,并為成都市生活垃圾管理條例草案提供建議。在教育方面,他們針對老年人的教育活動——廣場舞歌曲改編激發(fā)了各國評委的濃厚興趣。

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          軟件隊UESTC-Software繼承了2018年的項目BioMster1.0數(shù)據(jù)庫,打造出功能更強、性能更高的一站式生物磚檢索數(shù)據(jù)庫——BioMaster2.0。 BioMaster2.0數(shù)據(jù)庫在數(shù)據(jù)完備性、搜索準確性和用戶友好性上做出了重大升級,加入了SBOL可視化設(shè)計、未知序列EC編號預(yù)測功能,最大程度方便iGEMers檢索生物磚元件并設(shè)計自己的基因電路。BioMaster2.0設(shè)計過程遵循“需求分析-軟件實現(xiàn)-測試反饋”的迭代開發(fā)模型,無論是在前期確定數(shù)據(jù)庫內(nèi)容,還是后期優(yōu)化用戶操作流程,項目小組始終圍繞用戶實際需求,解決現(xiàn)實問題。BioMaster還考慮到數(shù)據(jù)更新與遷移問題,特意對項目的長期運營、維護進行優(yōu)化,目前已經(jīng)應(yīng)用于中科大及同濟參賽軟件隊的項目設(shè)計中,并受到他們的一致好評。在Giant Jamboree現(xiàn)場,許多隊伍前來試用BioMaster,對其提供的便利搜索加以贊揚,項目的完善性也讓各位裁判十分滿意,并表示電子科技大學(xué)iGEM團隊的長期維護與支持對全世界iGEM隊伍以及合成生物學(xué)家做出了巨大貢獻。該項目在Giant Jamboree上獲得最佳軟件項目。

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          功夫不負有心人,在總決賽答辯時,兩隊隊員們將項目設(shè)計和項目成果娓娓道來,并信心滿滿地回答了裁判們的所有提問。在poster展區(qū),裁判們對于兩隊項目構(gòu)思、產(chǎn)品功能、wiki、poster設(shè)計等方面給予贊賞,隊員們也與他們展開了更深入的探討和技術(shù)交流,對于項目中的model及human practices進行了充分的討論。針對軟件隊項目進行的人類實踐部分,各位裁判也是非常感興趣,并認為通過同學(xué)們的模型指導(dǎo)項目十分有益。實驗隊在會場還受到了來自Genscript公司的邀請,在鏡頭前介紹了今年的項目。

            在展示和交流環(huán)節(jié)中,兩隊的項目引得來自世界各地的隊伍紛紛駐足,其中不乏有蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院、威廉瑪麗學(xué)院、北京大學(xué)等強隊。此外,他們也與世界各地的競賽隊伍充分交換想法,汲取專業(yè)建議,啟發(fā)思維,在科研項目設(shè)計方面取得了長足進步。

          學(xué)思結(jié)合 寓教于樂 

            在過去的一整個夏天中,除了全身心投入項目,實驗隊和軟件隊也精誠合作,一同走進四川科技館,為來自200多個家庭的小朋友們帶去了科普性與趣味性兼具的合成生物學(xué)“大冒險”,舉辦“科普講堂,啟發(fā)新思維”“酸堿指示大變臉&畫筆涂繪生物世界”“樹葉貼畫&葉脈書簽制作”“科學(xué)小劇場——‘環(huán)丙沙星事變’”等一系列科普活動,讓iGEM與合成生物學(xué)在社會活動中走進公眾的視野,產(chǎn)生了良好反響。

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            此外,軟件隊員們基于合成生物學(xué)的自底向上逐層構(gòu)建的核心思想創(chuàng)建了一款桌游BioME,并精心設(shè)計了合成生物學(xué)科普性宣傳冊。這兩類產(chǎn)品在比賽準備中組織的宣講類活動中均有使用,并受到用戶的一致好評。在Giant Jamboree比賽現(xiàn)場,有許多其他團隊的成員對BioME頗感興趣,紛紛組隊競技;負責(zé)評判的裁判更是在答辯完之后特意前來試玩并對宣傳冊大加贊揚,表示這樣的輔助教學(xué)工具能讓更多的人了解到合成生物學(xué)及iGEM的應(yīng)用意義。

          而在2019年iGEMGiantJamboree會場展覽中,實驗隊將精心設(shè)計的裝置Drug Avenger帶到了現(xiàn)場。其中的熒光檢測裝置憑著可以媲美酶標儀的超高精度給在場評委以及隊伍留下了深刻的印象。Drug Avenger是一款集抗生素預(yù)處理、濃度檢測、降解于一體的硬件裝置,并含有配套的水箱用于稀釋和排水。它可以配合工程大腸桿菌實現(xiàn)環(huán)丙沙星的自動檢測與降解,同時其中的暗室和紫外保證了生物安全。該硬件在Giant Jamboree上獲得最佳硬件提名獎。

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          相關(guān)鏈接:

            國際基因工程機器設(shè)計大賽(iGEM)由美國麻省理工學(xué)院創(chuàng)辦于2003年。比賽涉及生物學(xué)、計算機科學(xué)、數(shù)學(xué)等多學(xué)科,是以合成生物學(xué)為核心的多學(xué)科交叉國際級科技競賽,在合成生物學(xué)領(lǐng)域有巨大影響力,其理念在于鼓勵大學(xué)生積極創(chuàng)新,用創(chuàng)新去改變世界。大賽組委會根據(jù)項目前沿性、創(chuàng)造性和完整性頒發(fā)金銀銅獎牌。同時,大賽還設(shè)置了Best Energy Project、Best Education & Public Engagement等單項獎,獎勵給某一方面出類撥萃的一個項目。



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